Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms