Protein–RNA interactions for Protein: O55125

Nipsnap1, Protein NipSnap homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap1O55125 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms