Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pole2O54956 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pole2O54956 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pole2O54956 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pole2O54956 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pole2O54956 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pole2O54956 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pole2O54956 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms