Protein–RNA interactions for Protein: O54901

Cd200, OX-2 membrane glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd200O54901 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd200O54901 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd200O54901 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd200O54901 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd200O54901 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd200O54901 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd200O54901 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd200O54901 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd200O54901 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd200O54901 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd200O54901 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd200O54901 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd200O54901 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd200O54901 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd200O54901 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd200O54901 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd200O54901 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd200O54901 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd200O54901 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd200O54901 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd200O54901 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd200O54901 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd200O54901 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd200O54901 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd200O54901 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd200O54901 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd200O54901 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd200O54901 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd200O54901 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd200O54901 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd200O54901 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd200O54901 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd200O54901 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd200O54901 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd200O54901 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd200O54901 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd200O54901 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd200O54901 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd200O54901 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd200O54901 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd200O54901 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd200O54901 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd200O54901 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd200O54901 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd200O54901 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd200O54901 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd200O54901 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd200O54901 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd200O54901 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd200O54901 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd200O54901 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd200O54901 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd200O54901 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd200O54901 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd200O54901 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd200O54901 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd200O54901 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd200O54901 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd200O54901 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd200O54901 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd200O54901 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd200O54901 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd200O54901 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd200O54901 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd200O54901 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd200O54901 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd200O54901 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd200O54901 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd200O54901 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd200O54901 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd200O54901 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd200O54901 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd200O54901 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd200O54901 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd200O54901 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd200O54901 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd200O54901 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd200O54901 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd200O54901 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd200O54901 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd200O54901 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd200O54901 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd200O54901 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd200O54901 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd200O54901 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd200O54901 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd200O54901 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd200O54901 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd200O54901 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd200O54901 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd200O54901 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd200O54901 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd200O54901 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd200O54901 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd200O54901 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd200O54901 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd200O54901 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd200O54901 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd200O54901 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd200O54901 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms