Protein–RNA interactions for Protein: O35926

Cdk5r2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r2O35926 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdk5r2O35926 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdk5r2O35926 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdk5r2O35926 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdk5r2O35926 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdk5r2O35926 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdk5r2O35926 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdk5r2O35926 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdk5r2O35926 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdk5r2O35926 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdk5r2O35926 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdk5r2O35926 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdk5r2O35926 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdk5r2O35926 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdk5r2O35926 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdk5r2O35926 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdk5r2O35926 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdk5r2O35926 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms