Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms