Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppfibp2O35711 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppfibp2O35711 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppfibp2O35711 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppfibp2O35711 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppfibp2O35711 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppfibp2O35711 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppfibp2O35711 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppfibp2O35711 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppfibp2O35711 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppfibp2O35711 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppfibp2O35711 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppfibp2O35711 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppfibp2O35711 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ppfibp2O35711 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ppfibp2O35711 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppfibp2O35711 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppfibp2O35711 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppfibp2O35711 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppfibp2O35711 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppfibp2O35711 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppfibp2O35711 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppfibp2O35711 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppfibp2O35711 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppfibp2O35711 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppfibp2O35711 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppfibp2O35711 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppfibp2O35711 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppfibp2O35711 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppfibp2O35711 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppfibp2O35711 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppfibp2O35711 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppfibp2O35711 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppfibp2O35711 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppfibp2O35711 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppfibp2O35711 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppfibp2O35711 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppfibp2O35711 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppfibp2O35711 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppfibp2O35711 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppfibp2O35711 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppfibp2O35711 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppfibp2O35711 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppfibp2O35711 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppfibp2O35711 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppfibp2O35711 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppfibp2O35711 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppfibp2O35711 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppfibp2O35711 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppfibp2O35711 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppfibp2O35711 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppfibp2O35711 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppfibp2O35711 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppfibp2O35711 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppfibp2O35711 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppfibp2O35711 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppfibp2O35711 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppfibp2O35711 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppfibp2O35711 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppfibp2O35711 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppfibp2O35711 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppfibp2O35711 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppfibp2O35711 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppfibp2O35711 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppfibp2O35711 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppfibp2O35711 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppfibp2O35711 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppfibp2O35711 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppfibp2O35711 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppfibp2O35711 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppfibp2O35711 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppfibp2O35711 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppfibp2O35711 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppfibp2O35711 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppfibp2O35711 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppfibp2O35711 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppfibp2O35711 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppfibp2O35711 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppfibp2O35711 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppfibp2O35711 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppfibp2O35711 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppfibp2O35711 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppfibp2O35711 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppfibp2O35711 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppfibp2O35711 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppfibp2O35711 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppfibp2O35711 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppfibp2O35711 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppfibp2O35711 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppfibp2O35711 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppfibp2O35711 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppfibp2O35711 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppfibp2O35711 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppfibp2O35711 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppfibp2O35711 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppfibp2O35711 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppfibp2O35711 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppfibp2O35711 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppfibp2O35711 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppfibp2O35711 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms