Protein–RNA interactions for Protein: O35691

Pnn, Pinin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnnO35691 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PnnO35691 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PnnO35691 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PnnO35691 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PnnO35691 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PnnO35691 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PnnO35691 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PnnO35691 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PnnO35691 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PnnO35691 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PnnO35691 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PnnO35691 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PnnO35691 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PnnO35691 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PnnO35691 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PnnO35691 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PnnO35691 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PnnO35691 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PnnO35691 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PnnO35691 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PnnO35691 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PnnO35691 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PnnO35691 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PnnO35691 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PnnO35691 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PnnO35691 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PnnO35691 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PnnO35691 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PnnO35691 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PnnO35691 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PnnO35691 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PnnO35691 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PnnO35691 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PnnO35691 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PnnO35691 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PnnO35691 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PnnO35691 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PnnO35691 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PnnO35691 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PnnO35691 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PnnO35691 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PnnO35691 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PnnO35691 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PnnO35691 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PnnO35691 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PnnO35691 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PnnO35691 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PnnO35691 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PnnO35691 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PnnO35691 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PnnO35691 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PnnO35691 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PnnO35691 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PnnO35691 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PnnO35691 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PnnO35691 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PnnO35691 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PnnO35691 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PnnO35691 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PnnO35691 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PnnO35691 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PnnO35691 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PnnO35691 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PnnO35691 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PnnO35691 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PnnO35691 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PnnO35691 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PnnO35691 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PnnO35691 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PnnO35691 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PnnO35691 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PnnO35691 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PnnO35691 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PnnO35691 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PnnO35691 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PnnO35691 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PnnO35691 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PnnO35691 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PnnO35691 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PnnO35691 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PnnO35691 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PnnO35691 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PnnO35691 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PnnO35691 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PnnO35691 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PnnO35691 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PnnO35691 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PnnO35691 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PnnO35691 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PnnO35691 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PnnO35691 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PnnO35691 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PnnO35691 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PnnO35691 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PnnO35691 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PnnO35691 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PnnO35691 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PnnO35691 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PnnO35691 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PnnO35691 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms