Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc27a2O35488 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc27a2O35488 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc27a2O35488 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc27a2O35488 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc27a2O35488 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc27a2O35488 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc27a2O35488 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc27a2O35488 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc27a2O35488 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc27a2O35488 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc27a2O35488 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc27a2O35488 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc27a2O35488 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc27a2O35488 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc27a2O35488 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc27a2O35488 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc27a2O35488 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc27a2O35488 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc27a2O35488 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc27a2O35488 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc27a2O35488 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc27a2O35488 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc27a2O35488 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc27a2O35488 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc27a2O35488 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc27a2O35488 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc27a2O35488 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc27a2O35488 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc27a2O35488 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Slc27a2O35488 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc27a2O35488 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc27a2O35488 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc27a2O35488 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc27a2O35488 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc27a2O35488 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc27a2O35488 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc27a2O35488 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc27a2O35488 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc27a2O35488 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc27a2O35488 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc27a2O35488 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc27a2O35488 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc27a2O35488 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc27a2O35488 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc27a2O35488 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc27a2O35488 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc27a2O35488 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc27a2O35488 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc27a2O35488 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc27a2O35488 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc27a2O35488 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc27a2O35488 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc27a2O35488 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc27a2O35488 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc27a2O35488 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc27a2O35488 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc27a2O35488 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc27a2O35488 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc27a2O35488 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc27a2O35488 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc27a2O35488 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc27a2O35488 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc27a2O35488 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc27a2O35488 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc27a2O35488 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc27a2O35488 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc27a2O35488 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc27a2O35488 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc27a2O35488 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc27a2O35488 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc27a2O35488 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc27a2O35488 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc27a2O35488 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc27a2O35488 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc27a2O35488 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc27a2O35488 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc27a2O35488 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc27a2O35488 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc27a2O35488 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc27a2O35488 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc27a2O35488 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc27a2O35488 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc27a2O35488 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc27a2O35488 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc27a2O35488 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc27a2O35488 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc27a2O35488 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc27a2O35488 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc27a2O35488 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc27a2O35488 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc27a2O35488 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc27a2O35488 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc27a2O35488 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc27a2O35488 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc27a2O35488 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc27a2O35488 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc27a2O35488 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc27a2O35488 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc27a2O35488 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms