Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
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Atf6bO35451 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Atf6bO35451 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf6bO35451 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Atf6bO35451 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf6bO35451 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf6bO35451 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf6bO35451 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Atf6bO35451 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf6bO35451 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Atf6bO35451 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Atf6bO35451 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf6bO35451 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf6bO35451 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Atf6bO35451 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Atf6bO35451 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Atf6bO35451 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms