Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2-ObO35424 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms