Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Abcc1O35379 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Abcc1O35379 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Abcc1O35379 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Abcc1O35379 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Abcc1O35379 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Abcc1O35379 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Abcc1O35379 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Abcc1O35379 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Abcc1O35379 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Abcc1O35379 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Abcc1O35379 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Abcc1O35379 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Abcc1O35379 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Abcc1O35379 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Abcc1O35379 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Abcc1O35379 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Abcc1O35379 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Abcc1O35379 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Abcc1O35379 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Abcc1O35379 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Abcc1O35379 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Abcc1O35379 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Abcc1O35379 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Abcc1O35379 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Abcc1O35379 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Abcc1O35379 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Abcc1O35379 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Abcc1O35379 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Abcc1O35379 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Abcc1O35379 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Abcc1O35379 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Abcc1O35379 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Abcc1O35379 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Abcc1O35379 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Abcc1O35379 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Abcc1O35379 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Abcc1O35379 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Abcc1O35379 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Abcc1O35379 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Abcc1O35379 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Abcc1O35379 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Abcc1O35379 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Abcc1O35379 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Abcc1O35379 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Abcc1O35379 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Abcc1O35379 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Abcc1O35379 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Abcc1O35379 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Abcc1O35379 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Abcc1O35379 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Abcc1O35379 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Abcc1O35379 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Abcc1O35379 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Abcc1O35379 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Abcc1O35379 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Abcc1O35379 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Abcc1O35379 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Abcc1O35379 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Abcc1O35379 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Abcc1O35379 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Abcc1O35379 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Abcc1O35379 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Abcc1O35379 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Abcc1O35379 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Abcc1O35379 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Abcc1O35379 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Abcc1O35379 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Abcc1O35379 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Abcc1O35379 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Abcc1O35379 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Abcc1O35379 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Abcc1O35379 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Abcc1O35379 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Abcc1O35379 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Abcc1O35379 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Abcc1O35379 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Abcc1O35379 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Abcc1O35379 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Abcc1O35379 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Abcc1O35379 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Abcc1O35379 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Abcc1O35379 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Abcc1O35379 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Abcc1O35379 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Abcc1O35379 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Abcc1O35379 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Abcc1O35379 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Abcc1O35379 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Abcc1O35379 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Abcc1O35379 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Abcc1O35379 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Abcc1O35379 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Abcc1O35379 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Abcc1O35379 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Abcc1O35379 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Abcc1O35379 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Abcc1O35379 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Abcc1O35379 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Abcc1O35379 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms