Protein–RNA interactions for Protein: O35310

Hs3st1, Heparan sulfate glucosamine 3-O-sulfotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hs3st1O35310 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hs3st1O35310 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hs3st1O35310 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hs3st1O35310 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hs3st1O35310 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms