Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlhe40O35185 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms