Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scarb2O35114 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scarb2O35114 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scarb2O35114 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scarb2O35114 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scarb2O35114 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scarb2O35114 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scarb2O35114 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scarb2O35114 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scarb2O35114 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scarb2O35114 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scarb2O35114 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scarb2O35114 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Scarb2O35114 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scarb2O35114 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scarb2O35114 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scarb2O35114 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scarb2O35114 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scarb2O35114 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scarb2O35114 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scarb2O35114 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scarb2O35114 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scarb2O35114 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scarb2O35114 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scarb2O35114 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scarb2O35114 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scarb2O35114 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scarb2O35114 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scarb2O35114 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scarb2O35114 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Scarb2O35114 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Scarb2O35114 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Scarb2O35114 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Scarb2O35114 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms