Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ArxO35085 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ArxO35085 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ArxO35085 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ArxO35085 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ArxO35085 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ArxO35085 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ArxO35085 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ArxO35085 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ArxO35085 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ArxO35085 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ArxO35085 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ArxO35085 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ArxO35085 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ArxO35085 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ArxO35085 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ArxO35085 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ArxO35085 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ArxO35085 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ArxO35085 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ArxO35085 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ArxO35085 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ArxO35085 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ArxO35085 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ArxO35085 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ArxO35085 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ArxO35085 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ArxO35085 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ArxO35085 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ArxO35085 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ArxO35085 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ArxO35085 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ArxO35085 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ArxO35085 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ArxO35085 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ArxO35085 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ArxO35085 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ArxO35085 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ArxO35085 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ArxO35085 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ArxO35085 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ArxO35085 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ArxO35085 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ArxO35085 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ArxO35085 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ArxO35085 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ArxO35085 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ArxO35085 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ArxO35085 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ArxO35085 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ArxO35085 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ArxO35085 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ArxO35085 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ArxO35085 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ArxO35085 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ArxO35085 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ArxO35085 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ArxO35085 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ArxO35085 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ArxO35085 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ArxO35085 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ArxO35085 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ArxO35085 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ArxO35085 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ArxO35085 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ArxO35085 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ArxO35085 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ArxO35085 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ArxO35085 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ArxO35085 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ArxO35085 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ArxO35085 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ArxO35085 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ArxO35085 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ArxO35085 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ArxO35085 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ArxO35085 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ArxO35085 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ArxO35085 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ArxO35085 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ArxO35085 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ArxO35085 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ArxO35085 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ArxO35085 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ArxO35085 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ArxO35085 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ArxO35085 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ArxO35085 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ArxO35085 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ArxO35085 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ArxO35085 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ArxO35085 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ArxO35085 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ArxO35085 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ArxO35085 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ArxO35085 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ArxO35085 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ArxO35085 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ArxO35085 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ArxO35085 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms