Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn4O35054 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn4O35054 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms