Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snap23O09044 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snap23O09044 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snap23O09044 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snap23O09044 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snap23O09044 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snap23O09044 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snap23O09044 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snap23O09044 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snap23O09044 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snap23O09044 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snap23O09044 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snap23O09044 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snap23O09044 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snap23O09044 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snap23O09044 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Snap23O09044 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snap23O09044 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snap23O09044 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snap23O09044 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snap23O09044 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snap23O09044 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snap23O09044 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Snap23O09044 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snap23O09044 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snap23O09044 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snap23O09044 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Snap23O09044 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snap23O09044 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snap23O09044 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snap23O09044 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snap23O09044 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Snap23O09044 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snap23O09044 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snap23O09044 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snap23O09044 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snap23O09044 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snap23O09044 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Snap23O09044 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snap23O09044 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Snap23O09044 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snap23O09044 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snap23O09044 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snap23O09044 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snap23O09044 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snap23O09044 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snap23O09044 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snap23O09044 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snap23O09044 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snap23O09044 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snap23O09044 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snap23O09044 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snap23O09044 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snap23O09044 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snap23O09044 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snap23O09044 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snap23O09044 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snap23O09044 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Snap23O09044 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Snap23O09044 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Snap23O09044 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snap23O09044 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snap23O09044 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snap23O09044 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snap23O09044 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Snap23O09044 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Snap23O09044 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snap23O09044 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snap23O09044 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snap23O09044 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Snap23O09044 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snap23O09044 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snap23O09044 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snap23O09044 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snap23O09044 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snap23O09044 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snap23O09044 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Snap23O09044 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snap23O09044 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snap23O09044 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snap23O09044 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snap23O09044 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snap23O09044 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snap23O09044 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snap23O09044 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snap23O09044 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Snap23O09044 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snap23O09044 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snap23O09044 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snap23O09044 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snap23O09044 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snap23O09044 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snap23O09044 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snap23O09044 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snap23O09044 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snap23O09044 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snap23O09044 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snap23O09044 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snap23O09044 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snap23O09044 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms