Protein–RNA interactions for Protein: O08788

Dctn1, Dynactin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn1O08788 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Dctn1O08788 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms