Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MttpO08601 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MttpO08601 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MttpO08601 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MttpO08601 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MttpO08601 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MttpO08601 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MttpO08601 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MttpO08601 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MttpO08601 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
MttpO08601 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MttpO08601 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MttpO08601 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MttpO08601 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
MttpO08601 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
MttpO08601 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MttpO08601 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MttpO08601 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MttpO08601 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MttpO08601 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MttpO08601 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MttpO08601 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MttpO08601 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MttpO08601 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MttpO08601 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MttpO08601 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MttpO08601 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MttpO08601 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MttpO08601 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MttpO08601 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MttpO08601 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MttpO08601 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MttpO08601 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MttpO08601 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MttpO08601 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MttpO08601 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MttpO08601 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MttpO08601 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MttpO08601 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MttpO08601 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MttpO08601 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MttpO08601 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MttpO08601 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MttpO08601 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MttpO08601 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MttpO08601 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MttpO08601 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MttpO08601 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MttpO08601 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MttpO08601 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MttpO08601 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MttpO08601 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MttpO08601 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MttpO08601 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MttpO08601 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MttpO08601 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MttpO08601 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MttpO08601 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MttpO08601 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MttpO08601 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MttpO08601 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MttpO08601 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MttpO08601 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MttpO08601 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MttpO08601 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MttpO08601 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MttpO08601 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MttpO08601 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MttpO08601 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MttpO08601 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MttpO08601 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MttpO08601 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MttpO08601 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MttpO08601 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MttpO08601 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
MttpO08601 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MttpO08601 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MttpO08601 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MttpO08601 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MttpO08601 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MttpO08601 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MttpO08601 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MttpO08601 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MttpO08601 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MttpO08601 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MttpO08601 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MttpO08601 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MttpO08601 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MttpO08601 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MttpO08601 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MttpO08601 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MttpO08601 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MttpO08601 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MttpO08601 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MttpO08601 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MttpO08601 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
MttpO08601 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MttpO08601 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MttpO08601 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MttpO08601 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms