Protein–RNA interactions for Protein: O08576

Rundc3a, RUN domain-containing protein 3A, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3aO08576 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rundc3aO08576 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rundc3aO08576 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rundc3aO08576 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rundc3aO08576 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rundc3aO08576 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rundc3aO08576 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rundc3aO08576 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rundc3aO08576 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rundc3aO08576 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rundc3aO08576 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rundc3aO08576 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rundc3aO08576 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rundc3aO08576 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rundc3aO08576 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rundc3aO08576 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rundc3aO08576 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rundc3aO08576 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rundc3aO08576 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rundc3aO08576 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms