Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sec22bO08547 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms