Protein–RNA interactions for Protein: O08546

U90926, Putative TNF-resistance related protein, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U90926O08546 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
U90926O08546 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
U90926O08546 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
U90926O08546 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
U90926O08546 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
U90926O08546 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
U90926O08546 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
U90926O08546 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
U90926O08546 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
U90926O08546 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
U90926O08546 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
U90926O08546 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
U90926O08546 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
U90926O08546 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
U90926O08546 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
U90926O08546 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
U90926O08546 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
U90926O08546 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
U90926O08546 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
U90926O08546 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
U90926O08546 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
U90926O08546 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
U90926O08546 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
U90926O08546 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
U90926O08546 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
U90926O08546 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
U90926O08546 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
U90926O08546 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
U90926O08546 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
U90926O08546 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
U90926O08546 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
U90926O08546 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
U90926O08546 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
U90926O08546 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
U90926O08546 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
U90926O08546 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
U90926O08546 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
U90926O08546 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
U90926O08546 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
U90926O08546 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
U90926O08546 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
U90926O08546 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
U90926O08546 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
U90926O08546 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
U90926O08546 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
U90926O08546 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
U90926O08546 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
U90926O08546 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
U90926O08546 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
U90926O08546 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
U90926O08546 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
U90926O08546 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
U90926O08546 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
U90926O08546 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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U90926O08546 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
U90926O08546 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
U90926O08546 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
U90926O08546 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
U90926O08546 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
U90926O08546 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
U90926O08546 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
U90926O08546 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
U90926O08546 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
U90926O08546 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
U90926O08546 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
U90926O08546 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
U90926O08546 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
U90926O08546 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
U90926O08546 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
U90926O08546 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
U90926O08546 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
U90926O08546 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
U90926O08546 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
U90926O08546 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
U90926O08546 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
U90926O08546 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
U90926O08546 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
U90926O08546 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
U90926O08546 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
U90926O08546 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
U90926O08546 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
U90926O08546 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
U90926O08546 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
U90926O08546 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
U90926O08546 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
U90926O08546 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
U90926O08546 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
U90926O08546 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
U90926O08546 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
U90926O08546 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
U90926O08546 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
U90926O08546 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
U90926O08546 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
U90926O08546 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
U90926O08546 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
U90926O08546 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
U90926O08546 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
U90926O08546 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
U90926O08546 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms