Protein–RNA interactions for Protein: K7N5P2

Gm3402, Predicted gene 3402, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3402K7N5P2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3402K7N5P2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3402K7N5P2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3402K7N5P2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3402K7N5P2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3402K7N5P2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3402K7N5P2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3402K7N5P2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3402K7N5P2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3402K7N5P2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3402K7N5P2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3402K7N5P2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3402K7N5P2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3402K7N5P2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3402K7N5P2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3402K7N5P2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3402K7N5P2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3402K7N5P2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3402K7N5P2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3402K7N5P2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3402K7N5P2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3402K7N5P2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3402K7N5P2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3402K7N5P2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3402K7N5P2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3402K7N5P2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3402K7N5P2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3402K7N5P2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3402K7N5P2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3402K7N5P2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3402K7N5P2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3402K7N5P2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3402K7N5P2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3402K7N5P2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3402K7N5P2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3402K7N5P2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3402K7N5P2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3402K7N5P2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3402K7N5P2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3402K7N5P2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3402K7N5P2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3402K7N5P2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3402K7N5P2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3402K7N5P2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3402K7N5P2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3402K7N5P2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3402K7N5P2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3402K7N5P2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3402K7N5P2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3402K7N5P2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3402K7N5P2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3402K7N5P2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3402K7N5P2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3402K7N5P2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3402K7N5P2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3402K7N5P2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm3402K7N5P2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm3402K7N5P2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm3402K7N5P2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm3402K7N5P2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms