Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Gm14152-201ENSMUST00000127020 1073 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Gm24239-201ENSMUST00000157791 255 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 9430037O13Rik-201ENSMUST00000192556 1008 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Gm38018-201ENSMUST00000195651 540 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Psmd10-201ENSMUST00000033805 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Gm14481-201ENSMUST00000117178 629 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Gm6938-201ENSMUST00000123014 771 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Gm37355-201ENSMUST00000193345 606 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Gm37676-201ENSMUST00000195496 507 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 AC165260.4-201ENSMUST00000225924 724 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Dapl1-201ENSMUST00000028369 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC8.9□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Gm9506-201ENSMUST00000118516 320 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 B230110G15Rik-201ENSMUST00000190868 772 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Ermard-209ENSMUST00000226561 1019 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms