Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm2056J3QQ02 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms