Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccer2J3QPU5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccer2J3QPU5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccer2J3QPU5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccer2J3QPU5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccer2J3QPU5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccer2J3QPU5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccer2J3QPU5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccer2J3QPU5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccer2J3QPU5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccer2J3QPU5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccer2J3QPU5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccer2J3QPU5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccer2J3QPU5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccer2J3QPU5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccer2J3QPU5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccer2J3QPU5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccer2J3QPU5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccer2J3QPU5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccer2J3QPU5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccer2J3QPU5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccer2J3QPU5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccer2J3QPU5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccer2J3QPU5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccer2J3QPU5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccer2J3QPU5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccer2J3QPU5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccer2J3QPU5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccer2J3QPU5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccer2J3QPU5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccer2J3QPU5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccer2J3QPU5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccer2J3QPU5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccer2J3QPU5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccer2J3QPU5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccer2J3QPU5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccer2J3QPU5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccer2J3QPU5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccer2J3QPU5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccer2J3QPU5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccer2J3QPU5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccer2J3QPU5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccer2J3QPU5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccer2J3QPU5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccer2J3QPU5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccer2J3QPU5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccer2J3QPU5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccer2J3QPU5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccer2J3QPU5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccer2J3QPU5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccer2J3QPU5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccer2J3QPU5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccer2J3QPU5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccer2J3QPU5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccer2J3QPU5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccer2J3QPU5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccer2J3QPU5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccer2J3QPU5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccer2J3QPU5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccer2J3QPU5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccer2J3QPU5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccer2J3QPU5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccer2J3QPU5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccer2J3QPU5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccer2J3QPU5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccer2J3QPU5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccer2J3QPU5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccer2J3QPU5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccer2J3QPU5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccer2J3QPU5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccer2J3QPU5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccer2J3QPU5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccer2J3QPU5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Ccer2J3QPU5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
Ccer2J3QPU5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccer2J3QPU5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccer2J3QPU5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccer2J3QPU5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccer2J3QPU5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccer2J3QPU5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccer2J3QPU5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccer2J3QPU5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccer2J3QPU5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccer2J3QPU5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccer2J3QPU5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccer2J3QPU5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccer2J3QPU5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccer2J3QPU5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccer2J3QPU5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccer2J3QPU5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccer2J3QPU5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccer2J3QPU5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccer2J3QPU5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccer2J3QPU5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccer2J3QPU5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccer2J3QPU5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccer2J3QPU5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccer2J3QPU5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccer2J3QPU5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccer2J3QPU5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms