Protein–RNA interactions for Protein: J3QPP2

Gm3685, Predicted gene 3685, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3685J3QPP2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms