Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BC024978J3QPC3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BC024978J3QPC3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BC024978J3QPC3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BC024978J3QPC3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BC024978J3QPC3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BC024978J3QPC3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BC024978J3QPC3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BC024978J3QPC3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BC024978J3QPC3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BC024978J3QPC3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BC024978J3QPC3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BC024978J3QPC3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BC024978J3QPC3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BC024978J3QPC3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BC024978J3QPC3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BC024978J3QPC3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BC024978J3QPC3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BC024978J3QPC3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
BC024978J3QPC3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BC024978J3QPC3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BC024978J3QPC3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BC024978J3QPC3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BC024978J3QPC3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BC024978J3QPC3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BC024978J3QPC3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BC024978J3QPC3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BC024978J3QPC3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BC024978J3QPC3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BC024978J3QPC3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BC024978J3QPC3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BC024978J3QPC3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BC024978J3QPC3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BC024978J3QPC3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BC024978J3QPC3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BC024978J3QPC3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BC024978J3QPC3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
BC024978J3QPC3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BC024978J3QPC3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BC024978J3QPC3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BC024978J3QPC3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BC024978J3QPC3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BC024978J3QPC3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BC024978J3QPC3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BC024978J3QPC3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BC024978J3QPC3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BC024978J3QPC3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BC024978J3QPC3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BC024978J3QPC3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BC024978J3QPC3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
BC024978J3QPC3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BC024978J3QPC3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BC024978J3QPC3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BC024978J3QPC3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BC024978J3QPC3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BC024978J3QPC3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BC024978J3QPC3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BC024978J3QPC3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BC024978J3QPC3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BC024978J3QPC3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BC024978J3QPC3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BC024978J3QPC3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BC024978J3QPC3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BC024978J3QPC3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BC024978J3QPC3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BC024978J3QPC3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BC024978J3QPC3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BC024978J3QPC3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BC024978J3QPC3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BC024978J3QPC3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BC024978J3QPC3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BC024978J3QPC3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BC024978J3QPC3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BC024978J3QPC3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BC024978J3QPC3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BC024978J3QPC3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BC024978J3QPC3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BC024978J3QPC3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BC024978J3QPC3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BC024978J3QPC3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BC024978J3QPC3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BC024978J3QPC3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BC024978J3QPC3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BC024978J3QPC3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BC024978J3QPC3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BC024978J3QPC3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BC024978J3QPC3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BC024978J3QPC3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BC024978J3QPC3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BC024978J3QPC3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BC024978J3QPC3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BC024978J3QPC3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BC024978J3QPC3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BC024978J3QPC3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BC024978J3QPC3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BC024978J3QPC3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BC024978J3QPC3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BC024978J3QPC3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
BC024978J3QPC3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BC024978J3QPC3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms