Protein–RNA interactions for Protein: J3QNY8

Gm19965, Predicted gene, 19965, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm19965J3QNY8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm19965J3QNY8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
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