Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34c2J3QNM1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34c2J3QNM1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34c2J3QNM1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34c2J3QNM1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34c2J3QNM1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34c2J3QNM1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34c2J3QNM1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34c2J3QNM1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34c2J3QNM1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34c2J3QNM1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34c2J3QNM1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34c2J3QNM1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34c2J3QNM1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34c2J3QNM1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34c2J3QNM1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34c2J3QNM1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34c2J3QNM1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn34c2J3QNM1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn34c2J3QNM1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn34c2J3QNM1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn34c2J3QNM1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn34c2J3QNM1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn34c2J3QNM1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn34c2J3QNM1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn34c2J3QNM1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn34c2J3QNM1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn34c2J3QNM1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn34c2J3QNM1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn34c2J3QNM1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn34c2J3QNM1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn34c2J3QNM1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn34c2J3QNM1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn34c2J3QNM1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn34c2J3QNM1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn34c2J3QNM1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn34c2J3QNM1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn34c2J3QNM1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn34c2J3QNM1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn34c2J3QNM1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn34c2J3QNM1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn34c2J3QNM1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34c2J3QNM1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34c2J3QNM1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34c2J3QNM1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34c2J3QNM1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34c2J3QNM1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34c2J3QNM1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34c2J3QNM1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34c2J3QNM1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34c2J3QNM1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34c2J3QNM1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34c2J3QNM1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34c2J3QNM1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34c2J3QNM1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34c2J3QNM1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34c2J3QNM1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34c2J3QNM1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34c2J3QNM1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34c2J3QNM1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34c2J3QNM1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34c2J3QNM1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34c2J3QNM1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34c2J3QNM1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34c2J3QNM1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34c2J3QNM1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34c2J3QNM1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34c2J3QNM1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34c2J3QNM1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34c2J3QNM1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34c2J3QNM1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34c2J3QNM1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34c2J3QNM1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34c2J3QNM1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34c2J3QNM1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34c2J3QNM1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34c2J3QNM1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34c2J3QNM1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34c2J3QNM1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34c2J3QNM1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34c2J3QNM1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34c2J3QNM1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34c2J3QNM1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34c2J3QNM1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34c2J3QNM1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34c2J3QNM1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34c2J3QNM1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34c2J3QNM1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34c2J3QNM1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34c2J3QNM1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34c2J3QNM1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34c2J3QNM1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34c2J3QNM1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34c2J3QNM1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34c2J3QNM1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34c2J3QNM1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34c2J3QNM1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34c2J3QNM1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34c2J3QNM1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34c2J3QNM1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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