Protein–RNA interactions for Protein: J3QME6

Lipo1, Lipase, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lipo1J3QME6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lipo1J3QME6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lipo1J3QME6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lipo1J3QME6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lipo1J3QME6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lipo1J3QME6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lipo1J3QME6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lipo1J3QME6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lipo1J3QME6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lipo1J3QME6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lipo1J3QME6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lipo1J3QME6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lipo1J3QME6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lipo1J3QME6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lipo1J3QME6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lipo1J3QME6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lipo1J3QME6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lipo1J3QME6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lipo1J3QME6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lipo1J3QME6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lipo1J3QME6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lipo1J3QME6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lipo1J3QME6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Lipo1J3QME6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lipo1J3QME6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lipo1J3QME6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Lipo1J3QME6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lipo1J3QME6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lipo1J3QME6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lipo1J3QME6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lipo1J3QME6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lipo1J3QME6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lipo1J3QME6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lipo1J3QME6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lipo1J3QME6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lipo1J3QME6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lipo1J3QME6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lipo1J3QME6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lipo1J3QME6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lipo1J3QME6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lipo1J3QME6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lipo1J3QME6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lipo1J3QME6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lipo1J3QME6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lipo1J3QME6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lipo1J3QME6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lipo1J3QME6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Lipo1J3QME6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lipo1J3QME6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lipo1J3QME6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lipo1J3QME6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lipo1J3QME6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lipo1J3QME6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lipo1J3QME6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lipo1J3QME6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lipo1J3QME6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lipo1J3QME6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lipo1J3QME6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Lipo1J3QME6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lipo1J3QME6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lipo1J3QME6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lipo1J3QME6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Lipo1J3QME6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lipo1J3QME6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lipo1J3QME6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lipo1J3QME6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lipo1J3QME6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lipo1J3QME6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lipo1J3QME6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lipo1J3QME6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lipo1J3QME6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lipo1J3QME6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lipo1J3QME6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lipo1J3QME6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lipo1J3QME6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lipo1J3QME6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lipo1J3QME6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Lipo1J3QME6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lipo1J3QME6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lipo1J3QME6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lipo1J3QME6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lipo1J3QME6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lipo1J3QME6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lipo1J3QME6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lipo1J3QME6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lipo1J3QME6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lipo1J3QME6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lipo1J3QME6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lipo1J3QME6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lipo1J3QME6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Lipo1J3QME6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lipo1J3QME6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Lipo1J3QME6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Lipo1J3QME6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lipo1J3QME6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lipo1J3QME6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Lipo1J3QME6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lipo1J3QME6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lipo1J3QME6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lipo1J3QME6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms