Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Gm21818J3KMS6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Gm21818J3KMS6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Gm21818J3KMS6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Gm21818J3KMS6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Gm21818J3KMS6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Gm21818J3KMS6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Gm21818J3KMS6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Gm21818J3KMS6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Gm21818J3KMS6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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