Protein–RNA interactions for Protein: I3ITR1

AK157302, MCG50313, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AK157302I3ITR1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AK157302I3ITR1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AK157302I3ITR1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AK157302I3ITR1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AK157302I3ITR1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
AK157302I3ITR1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
AK157302I3ITR1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AK157302I3ITR1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AK157302I3ITR1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AK157302I3ITR1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AK157302I3ITR1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AK157302I3ITR1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AK157302I3ITR1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AK157302I3ITR1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AK157302I3ITR1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AK157302I3ITR1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AK157302I3ITR1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AK157302I3ITR1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
AK157302I3ITR1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AK157302I3ITR1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AK157302I3ITR1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AK157302I3ITR1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AK157302I3ITR1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms