Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pot1bH7BX60 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pot1bH7BX60 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pot1bH7BX60 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pot1bH7BX60 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pot1bH7BX60 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Pot1bH7BX60 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pot1bH7BX60 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pot1bH7BX60 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pot1bH7BX60 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pot1bH7BX60 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pot1bH7BX60 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pot1bH7BX60 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pot1bH7BX60 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pot1bH7BX60 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pot1bH7BX60 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pot1bH7BX60 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pot1bH7BX60 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pot1bH7BX60 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pot1bH7BX60 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pot1bH7BX60 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pot1bH7BX60 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pot1bH7BX60 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pot1bH7BX60 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pot1bH7BX60 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pot1bH7BX60 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pot1bH7BX60 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pot1bH7BX60 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pot1bH7BX60 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pot1bH7BX60 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pot1bH7BX60 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pot1bH7BX60 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pot1bH7BX60 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pot1bH7BX60 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pot1bH7BX60 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pot1bH7BX60 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pot1bH7BX60 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pot1bH7BX60 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pot1bH7BX60 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pot1bH7BX60 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pot1bH7BX60 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pot1bH7BX60 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms