Protein–RNA interactions for Protein: H3BKF4

Gm20708, Predicted gene 20708, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20708H3BKF4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20708H3BKF4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20708H3BKF4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms