Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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