Protein–RNA interactions for Protein: G5E8I7

Usp17lc, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein C, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lcG5E8I7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp17lcG5E8I7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp17lcG5E8I7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp17lcG5E8I7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp17lcG5E8I7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp17lcG5E8I7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp17lcG5E8I7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp17lcG5E8I7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp17lcG5E8I7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp17lcG5E8I7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp17lcG5E8I7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp17lcG5E8I7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp17lcG5E8I7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp17lcG5E8I7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp17lcG5E8I7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp17lcG5E8I7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp17lcG5E8I7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp17lcG5E8I7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp17lcG5E8I7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp17lcG5E8I7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp17lcG5E8I7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp17lcG5E8I7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp17lcG5E8I7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp17lcG5E8I7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp17lcG5E8I7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp17lcG5E8I7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp17lcG5E8I7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp17lcG5E8I7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp17lcG5E8I7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp17lcG5E8I7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp17lcG5E8I7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp17lcG5E8I7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp17lcG5E8I7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp17lcG5E8I7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp17lcG5E8I7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp17lcG5E8I7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
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Usp17lcG5E8I7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp17lcG5E8I7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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Usp17lcG5E8I7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp17lcG5E8I7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
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Usp17lcG5E8I7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp17lcG5E8I7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp17lcG5E8I7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp17lcG5E8I7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp17lcG5E8I7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
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Usp17lcG5E8I7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp17lcG5E8I7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp17lcG5E8I7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp17lcG5E8I7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp17lcG5E8I7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp17lcG5E8I7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp17lcG5E8I7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp17lcG5E8I7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp17lcG5E8I7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp17lcG5E8I7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp17lcG5E8I7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp17lcG5E8I7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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Usp17lcG5E8I7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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Usp17lcG5E8I7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp17lcG5E8I7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp17lcG5E8I7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp17lcG5E8I7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp17lcG5E8I7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp17lcG5E8I7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp17lcG5E8I7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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Usp17lcG5E8I7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp17lcG5E8I7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp17lcG5E8I7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp17lcG5E8I7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp17lcG5E8I7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp17lcG5E8I7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp17lcG5E8I7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp17lcG5E8I7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp17lcG5E8I7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp17lcG5E8I7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp17lcG5E8I7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp17lcG5E8I7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp17lcG5E8I7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp17lcG5E8I7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp17lcG5E8I7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp17lcG5E8I7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp17lcG5E8I7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp17lcG5E8I7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp17lcG5E8I7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp17lcG5E8I7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp17lcG5E8I7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp17lcG5E8I7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp17lcG5E8I7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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