Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r58G3X9U3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r58G3X9U3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.5 ms