Protein–RNA interactions for Protein: G3X8R9

Tmigd3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd3G3X8R9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmigd3G3X8R9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms