Protein–RNA interactions for Protein: F8VQB8

Npcd, Neuronal pentraxin chromo domain, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NpcdF8VQB8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms