Protein–RNA interactions for Protein: F7CCV5

Gm3443, Predicted gene 3443, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3443F7CCV5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm3443F7CCV5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3443F7CCV5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3443F7CCV5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3443F7CCV5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3443F7CCV5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3443F7CCV5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3443F7CCV5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3443F7CCV5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3443F7CCV5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3443F7CCV5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3443F7CCV5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3443F7CCV5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3443F7CCV5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3443F7CCV5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3443F7CCV5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3443F7CCV5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3443F7CCV5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3443F7CCV5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3443F7CCV5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3443F7CCV5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3443F7CCV5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3443F7CCV5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3443F7CCV5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3443F7CCV5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3443F7CCV5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3443F7CCV5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3443F7CCV5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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