Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Gm28048F7BCN0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
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Gm28048F7BCN0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Gm28048F7BCN0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Gm28048F7BCN0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Gm28048F7BCN0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Gm28048F7BCN0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Gm28048F7BCN0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Gm28048F7BCN0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Gm28048F7BCN0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Gm28048F7BCN0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Gm28048F7BCN0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Gm28048F7BCN0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
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