Protein–RNA interactions for Protein: F6Z6Z2

3110082J24Rik, RIKEN cDNA 3110082J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3110082J24RikF6Z6Z2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
3110082J24RikF6Z6Z2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
3110082J24RikF6Z6Z2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
3110082J24RikF6Z6Z2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
3110082J24RikF6Z6Z2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
3110082J24RikF6Z6Z2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
3110082J24RikF6Z6Z2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
3110082J24RikF6Z6Z2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
3110082J24RikF6Z6Z2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
3110082J24RikF6Z6Z2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
3110082J24RikF6Z6Z2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
3110082J24RikF6Z6Z2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
3110082J24RikF6Z6Z2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
3110082J24RikF6Z6Z2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
3110082J24RikF6Z6Z2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
3110082J24RikF6Z6Z2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
3110082J24RikF6Z6Z2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
3110082J24RikF6Z6Z2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18■□□□□ 0.47
3110082J24RikF6Z6Z2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
3110082J24RikF6Z6Z2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
3110082J24RikF6Z6Z2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
3110082J24RikF6Z6Z2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
3110082J24RikF6Z6Z2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
3110082J24RikF6Z6Z2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
3110082J24RikF6Z6Z2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
3110082J24RikF6Z6Z2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
3110082J24RikF6Z6Z2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
3110082J24RikF6Z6Z2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
3110082J24RikF6Z6Z2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
3110082J24RikF6Z6Z2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
3110082J24RikF6Z6Z2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
3110082J24RikF6Z6Z2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
3110082J24RikF6Z6Z2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
3110082J24RikF6Z6Z2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
3110082J24RikF6Z6Z2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
3110082J24RikF6Z6Z2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
3110082J24RikF6Z6Z2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
3110082J24RikF6Z6Z2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
3110082J24RikF6Z6Z2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
3110082J24RikF6Z6Z2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
3110082J24RikF6Z6Z2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
3110082J24RikF6Z6Z2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
3110082J24RikF6Z6Z2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
3110082J24RikF6Z6Z2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
3110082J24RikF6Z6Z2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
3110082J24RikF6Z6Z2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
3110082J24RikF6Z6Z2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
3110082J24RikF6Z6Z2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
3110082J24RikF6Z6Z2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
3110082J24RikF6Z6Z2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
3110082J24RikF6Z6Z2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
3110082J24RikF6Z6Z2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
3110082J24RikF6Z6Z2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
3110082J24RikF6Z6Z2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
3110082J24RikF6Z6Z2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
3110082J24RikF6Z6Z2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms