Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cald1E9QA15 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cald1E9QA15 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cald1E9QA15 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cald1E9QA15 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cald1E9QA15 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cald1E9QA15 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cald1E9QA15 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cald1E9QA15 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cald1E9QA15 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cald1E9QA15 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cald1E9QA15 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cald1E9QA15 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cald1E9QA15 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cald1E9QA15 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cald1E9QA15 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cald1E9QA15 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cald1E9QA15 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cald1E9QA15 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cald1E9QA15 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cald1E9QA15 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cald1E9QA15 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cald1E9QA15 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cald1E9QA15 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cald1E9QA15 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cald1E9QA15 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cald1E9QA15 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cald1E9QA15 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cald1E9QA15 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cald1E9QA15 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cald1E9QA15 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cald1E9QA15 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cald1E9QA15 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cald1E9QA15 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cald1E9QA15 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cald1E9QA15 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cald1E9QA15 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cald1E9QA15 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cald1E9QA15 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cald1E9QA15 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cald1E9QA15 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cald1E9QA15 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cald1E9QA15 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cald1E9QA15 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cald1E9QA15 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cald1E9QA15 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cald1E9QA15 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cald1E9QA15 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cald1E9QA15 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cald1E9QA15 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cald1E9QA15 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cald1E9QA15 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cald1E9QA15 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cald1E9QA15 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cald1E9QA15 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cald1E9QA15 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cald1E9QA15 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cald1E9QA15 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cald1E9QA15 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cald1E9QA15 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cald1E9QA15 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cald1E9QA15 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cald1E9QA15 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cald1E9QA15 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cald1E9QA15 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cald1E9QA15 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cald1E9QA15 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cald1E9QA15 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cald1E9QA15 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cald1E9QA15 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cald1E9QA15 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cald1E9QA15 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cald1E9QA15 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cald1E9QA15 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cald1E9QA15 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cald1E9QA15 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cald1E9QA15 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cald1E9QA15 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cald1E9QA15 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cald1E9QA15 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cald1E9QA15 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cald1E9QA15 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cald1E9QA15 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cald1E9QA15 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cald1E9QA15 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cald1E9QA15 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cald1E9QA15 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cald1E9QA15 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cald1E9QA15 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cald1E9QA15 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cald1E9QA15 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cald1E9QA15 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cald1E9QA15 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cald1E9QA15 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cald1E9QA15 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cald1E9QA15 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cald1E9QA15 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cald1E9QA15 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cald1E9QA15 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cald1E9QA15 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms