Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U0

Usp17lb, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lbE9Q9U0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp17lbE9Q9U0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp17lbE9Q9U0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp17lbE9Q9U0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp17lbE9Q9U0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp17lbE9Q9U0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp17lbE9Q9U0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp17lbE9Q9U0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp17lbE9Q9U0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp17lbE9Q9U0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp17lbE9Q9U0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp17lbE9Q9U0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp17lbE9Q9U0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp17lbE9Q9U0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp17lbE9Q9U0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp17lbE9Q9U0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp17lbE9Q9U0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp17lbE9Q9U0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp17lbE9Q9U0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp17lbE9Q9U0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp17lbE9Q9U0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp17lbE9Q9U0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp17lbE9Q9U0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp17lbE9Q9U0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp17lbE9Q9U0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp17lbE9Q9U0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp17lbE9Q9U0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp17lbE9Q9U0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp17lbE9Q9U0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp17lbE9Q9U0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp17lbE9Q9U0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp17lbE9Q9U0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp17lbE9Q9U0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp17lbE9Q9U0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp17lbE9Q9U0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp17lbE9Q9U0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp17lbE9Q9U0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp17lbE9Q9U0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp17lbE9Q9U0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp17lbE9Q9U0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp17lbE9Q9U0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp17lbE9Q9U0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp17lbE9Q9U0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp17lbE9Q9U0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp17lbE9Q9U0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp17lbE9Q9U0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp17lbE9Q9U0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp17lbE9Q9U0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp17lbE9Q9U0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp17lbE9Q9U0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp17lbE9Q9U0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp17lbE9Q9U0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp17lbE9Q9U0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp17lbE9Q9U0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp17lbE9Q9U0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp17lbE9Q9U0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp17lbE9Q9U0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp17lbE9Q9U0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp17lbE9Q9U0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp17lbE9Q9U0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp17lbE9Q9U0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms