Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc146E9Q9F7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc146E9Q9F7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc146E9Q9F7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc146E9Q9F7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc146E9Q9F7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ccdc146E9Q9F7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc146E9Q9F7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc146E9Q9F7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc146E9Q9F7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms