Protein–RNA interactions for Protein: E9Q956

Mcmdc2, Minichromosome maintenance domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcmdc2E9Q956 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mcmdc2E9Q956 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mcmdc2E9Q956 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mcmdc2E9Q956 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mcmdc2E9Q956 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mcmdc2E9Q956 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mcmdc2E9Q956 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mcmdc2E9Q956 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mcmdc2E9Q956 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mcmdc2E9Q956 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mcmdc2E9Q956 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mcmdc2E9Q956 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mcmdc2E9Q956 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mcmdc2E9Q956 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mcmdc2E9Q956 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mcmdc2E9Q956 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mcmdc2E9Q956 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mcmdc2E9Q956 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mcmdc2E9Q956 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mcmdc2E9Q956 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mcmdc2E9Q956 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mcmdc2E9Q956 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mcmdc2E9Q956 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms