Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Urb2E9Q7L1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Urb2E9Q7L1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Urb2E9Q7L1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Urb2E9Q7L1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Urb2E9Q7L1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Urb2E9Q7L1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Urb2E9Q7L1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Urb2E9Q7L1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Urb2E9Q7L1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Urb2E9Q7L1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Urb2E9Q7L1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Urb2E9Q7L1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Urb2E9Q7L1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Urb2E9Q7L1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Urb2E9Q7L1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Urb2E9Q7L1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Urb2E9Q7L1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Urb2E9Q7L1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Urb2E9Q7L1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Urb2E9Q7L1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Urb2E9Q7L1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Urb2E9Q7L1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Urb2E9Q7L1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Urb2E9Q7L1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Urb2E9Q7L1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Urb2E9Q7L1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Urb2E9Q7L1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Urb2E9Q7L1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Urb2E9Q7L1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Urb2E9Q7L1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Urb2E9Q7L1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Urb2E9Q7L1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Urb2E9Q7L1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Urb2E9Q7L1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Urb2E9Q7L1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Urb2E9Q7L1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Urb2E9Q7L1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Urb2E9Q7L1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Urb2E9Q7L1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Urb2E9Q7L1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Urb2E9Q7L1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Urb2E9Q7L1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Urb2E9Q7L1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Urb2E9Q7L1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Urb2E9Q7L1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Urb2E9Q7L1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Urb2E9Q7L1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Urb2E9Q7L1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Urb2E9Q7L1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Urb2E9Q7L1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Urb2E9Q7L1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Urb2E9Q7L1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Urb2E9Q7L1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Urb2E9Q7L1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Urb2E9Q7L1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Urb2E9Q7L1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Urb2E9Q7L1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Urb2E9Q7L1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Urb2E9Q7L1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Urb2E9Q7L1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Urb2E9Q7L1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Urb2E9Q7L1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Urb2E9Q7L1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Urb2E9Q7L1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Urb2E9Q7L1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Urb2E9Q7L1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Urb2E9Q7L1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Urb2E9Q7L1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Urb2E9Q7L1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Urb2E9Q7L1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Urb2E9Q7L1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Urb2E9Q7L1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Urb2E9Q7L1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Urb2E9Q7L1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Urb2E9Q7L1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Urb2E9Q7L1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Urb2E9Q7L1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Urb2E9Q7L1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Urb2E9Q7L1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Urb2E9Q7L1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Urb2E9Q7L1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Urb2E9Q7L1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Urb2E9Q7L1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Urb2E9Q7L1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Urb2E9Q7L1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Urb2E9Q7L1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Urb2E9Q7L1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Urb2E9Q7L1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Urb2E9Q7L1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Urb2E9Q7L1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Urb2E9Q7L1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Urb2E9Q7L1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Urb2E9Q7L1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Urb2E9Q7L1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Urb2E9Q7L1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Urb2E9Q7L1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Urb2E9Q7L1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Urb2E9Q7L1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Urb2E9Q7L1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms