Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms